Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTRNP46939 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTRNP46939 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTRNP46939 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTRNP46939 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTRNP46939 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTRNP46939 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTRNP46939 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTRNP46939 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTRNP46939 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTRNP46939 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UTRNP46939 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UTRNP46939 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UTRNP46939 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UTRNP46939 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UTRNP46939 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UTRNP46939 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UTRNP46939 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UTRNP46939 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UTRNP46939 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UTRNP46939 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UTRNP46939 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UTRNP46939 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UTRNP46939 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UTRNP46939 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UTRNP46939 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UTRNP46939 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UTRNP46939 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UTRNP46939 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UTRNP46939 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UTRNP46939 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UTRNP46939 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UTRNP46939 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UTRNP46939 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UTRNP46939 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UTRNP46939 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UTRNP46939 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UTRNP46939 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UTRNP46939 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UTRNP46939 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UTRNP46939 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UTRNP46939 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UTRNP46939 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UTRNP46939 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UTRNP46939 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UTRNP46939 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UTRNP46939 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UTRNP46939 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UTRNP46939 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UTRNP46939 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UTRNP46939 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UTRNP46939 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UTRNP46939 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UTRNP46939 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UTRNP46939 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UTRNP46939 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UTRNP46939 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UTRNP46939 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UTRNP46939 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UTRNP46939 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UTRNP46939 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UTRNP46939 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UTRNP46939 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UTRNP46939 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UTRNP46939 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UTRNP46939 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UTRNP46939 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UTRNP46939 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UTRNP46939 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UTRNP46939 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UTRNP46939 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UTRNP46939 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UTRNP46939 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UTRNP46939 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UTRNP46939 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UTRNP46939 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UTRNP46939 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UTRNP46939 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UTRNP46939 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UTRNP46939 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UTRNP46939 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UTRNP46939 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
UTRNP46939 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
UTRNP46939 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
UTRNP46939 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UTRNP46939 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UTRNP46939 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UTRNP46939 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UTRNP46939 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UTRNP46939 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UTRNP46939 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UTRNP46939 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UTRNP46939 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UTRNP46939 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UTRNP46939 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UTRNP46939 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UTRNP46939 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UTRNP46939 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UTRNP46939 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UTRNP46939 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms