Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms