Protein–RNA interactions for Protein: P05783

KRT18, Keratin, type I cytoskeletal 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P05783 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT18P05783 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT18P05783 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT18P05783 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT18P05783 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT18P05783 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT18P05783 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT18P05783 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT18P05783 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT18P05783 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT18P05783 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT18P05783 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT18P05783 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT18P05783 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT18P05783 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT18P05783 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT18P05783 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT18P05783 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT18P05783 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT18P05783 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT18P05783 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT18P05783 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT18P05783 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT18P05783 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT18P05783 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT18P05783 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT18P05783 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT18P05783 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT18P05783 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT18P05783 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT18P05783 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT18P05783 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT18P05783 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT18P05783 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT18P05783 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT18P05783 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT18P05783 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT18P05783 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT18P05783 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT18P05783 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT18P05783 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT18P05783 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT18P05783 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT18P05783 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT18P05783 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT18P05783 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT18P05783 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT18P05783 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT18P05783 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT18P05783 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT18P05783 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT18P05783 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT18P05783 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT18P05783 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT18P05783 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT18P05783 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT18P05783 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT18P05783 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT18P05783 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT18P05783 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT18P05783 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT18P05783 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT18P05783 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT18P05783 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT18P05783 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT18P05783 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT18P05783 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT18P05783 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT18P05783 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT18P05783 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT18P05783 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT18P05783 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT18P05783 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT18P05783 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT18P05783 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT18P05783 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT18P05783 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT18P05783 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT18P05783 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT18P05783 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT18P05783 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT18P05783 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT18P05783 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT18P05783 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT18P05783 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT18P05783 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT18P05783 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT18P05783 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT18P05783 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT18P05783 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT18P05783 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT18P05783 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT18P05783 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT18P05783 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT18P05783 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT18P05783 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT18P05783 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT18P05783 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT18P05783 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT18P05783 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms