Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb3D3Z6J4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms