Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORCS3Q9UPU3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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