Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ14

Trpd52l3, Tumor protein D52-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpd52l3Q9CQ14 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Trpd52l3Q9CQ14 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Trpd52l3Q9CQ14 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Trpd52l3Q9CQ14 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Trpd52l3Q9CQ14 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpd52l3Q9CQ14 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Trpd52l3Q9CQ14 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Trpd52l3Q9CQ14 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpd52l3Q9CQ14 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpd52l3Q9CQ14 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpd52l3Q9CQ14 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpd52l3Q9CQ14 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpd52l3Q9CQ14 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpd52l3Q9CQ14 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Trpd52l3Q9CQ14 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpd52l3Q9CQ14 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpd52l3Q9CQ14 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpd52l3Q9CQ14 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpd52l3Q9CQ14 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms