Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDHR2Q9BYE9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDHR2Q9BYE9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDHR2Q9BYE9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDHR2Q9BYE9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDHR2Q9BYE9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDHR2Q9BYE9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDHR2Q9BYE9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDHR2Q9BYE9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDHR2Q9BYE9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDHR2Q9BYE9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDHR2Q9BYE9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDHR2Q9BYE9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDHR2Q9BYE9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDHR2Q9BYE9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDHR2Q9BYE9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDHR2Q9BYE9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDHR2Q9BYE9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDHR2Q9BYE9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDHR2Q9BYE9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDHR2Q9BYE9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDHR2Q9BYE9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDHR2Q9BYE9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms