Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms