Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM87AQ8NBN3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM87AQ8NBN3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms