Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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