Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rbm48Q8K2X2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rbm48Q8K2X2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rbm48Q8K2X2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rbm48Q8K2X2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rbm48Q8K2X2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rbm48Q8K2X2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rbm48Q8K2X2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rbm48Q8K2X2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rbm48Q8K2X2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rbm48Q8K2X2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rbm48Q8K2X2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rbm48Q8K2X2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rbm48Q8K2X2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rbm48Q8K2X2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rbm48Q8K2X2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rbm48Q8K2X2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rbm48Q8K2X2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm48Q8K2X2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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