Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTF1AQ7RTS3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms