Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms