Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC149Q6ZUS6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms