Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3HQ6NTF7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms