Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NCBP3Q53F19 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCBP3Q53F19 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms