Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF4Q15306 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms