Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NAE1Q13564 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms