Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.32□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.32□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.32□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.32□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 YCL019WYCL019W 5313 nt3.32□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.32□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.32□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.32□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.32□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 YER023C-AYER023C-A 213 nt3.32□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 HYR1YIR037W 492 nt3.32□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 UTP30YKR060W 825 nt3.32□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 REV1YOR346W 2958 nt3.32□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 RAD5YLR032W 3510 nt3.31□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 RPN2YIL075C 2838 nt3.31□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 YPK1YKL126W 2043 nt3.31□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 YDL011CYDL011C 324 nt3.31□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 AST2YER101C 1293 nt3.31□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 TMA22YJR014W 597 nt3.31□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 BLI1YKL061W 342 nt3.31□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 LCL2YLR104W 396 nt3.31□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 RPL26AYLR344W 384 nt3.31□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 YBL065WYBL065W 345 nt3.31□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 NUP82YJL061W 2142 nt3.31□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 VPS52YDR484W 1926 nt3.31□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 RKM1YPL208W 1752 nt3.3□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 FUS1YCL027W 1539 nt3.3□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 YGL149WYGL149W 306 nt3.3□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt3.3□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 NCE101YJL205C 162 nt3.3□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 YGR067CYGR067C 2415 nt3.3□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 RPA190YOR341W 4995 nt3.3□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 RGC1YPR115W 3252 nt3.29□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 RSE1YML049C 4086 nt3.29□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 SQS1YNL224C 2304 nt3.29□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 YDL041WYDL041W 354 nt3.29□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 RPS22AYJL190C 393 nt3.29□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 RPL6AYML073C 531 nt3.29□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 YPL182CYPL182C 384 nt3.29□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 ROG1YGL144C 2058 nt3.29□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 ESL1YIL151C 3357 nt3.29□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 BRO1YPL084W 2535 nt3.28□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 POL3YDL102W 3294 nt3.28□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 LYS9YNR050C 1341 nt3.28□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 PRK1YIL095W 2433 nt3.28□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 YDR193WYDR193W 399 nt3.28□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 DAD4YDR320C-A 219 nt3.28□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 CYC7YEL039C 342 nt3.28□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 YMR31YFR049W 372 nt3.28□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt3.28□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 RPS18BYML026C 441 nt3.28□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 SMA2YML066C 1110 nt3.28□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 POM152YMR129W 4014 nt3.28□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 SET1YHR119W 3243 nt3.27□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 RCY1YJL204C 2523 nt3.27□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 PFK26YIL107C 2484 nt3.27□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 MZM1YDR493W 372 nt3.27□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 TMA10YLR327C 261 nt3.27□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 ATP15YPL271W 189 nt3.27□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 YME2YMR302C 2553 nt3.27□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 JIP5YPR169W 1479 nt3.27□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 TOM70YNL121C 1854 nt3.26□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 IRC10YOL015W 1761 nt3.26□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 WIP1YDR374W-A 270 nt3.26□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt3.26□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 YKR033CYKR033C 426 nt3.26□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 MDV1YJL112W 2145 nt3.26□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 BUD4YJR092W 4344 nt3.26□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 CDC20YGL116W 1833 nt3.26□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 GYP7YDL234C 2241 nt3.25□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 BNA4YBL098W 1383 nt3.25□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 HSK3YKL138C-A 210 nt3.25□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 TAR1YLR154W-C 375 nt3.25□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt3.25□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 YJL181WYJL181W 1836 nt3.25□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 STE6YKL209C 3873 nt3.24□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 ECM25YJL201W 1800 nt3.24□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 RLF2YPR018W 1821 nt3.24□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 snR79snR79 84 nt3.24□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 RPL33AYPL143W 324 nt3.24□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 SPB1YCL054W 2526 nt3.24□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 SPO14YKR031C 5052 nt3.24□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 BOI1YBL085W 2943 nt3.23□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 DBP7YKR024C 2229 nt3.23□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 DYN2YDR424C 279 nt3.23□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 RPS24AYER074W 408 nt3.23□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 MGR1YCL044C 1254 nt3.23□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 SNQ2YDR011W 4506 nt3.23□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 SSE1YPL106C 2082 nt3.23□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 SGO1YOR073W 1773 nt3.23□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 YIL166CYIL166C 1629 nt3.22□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 SPO71YDR104C 3738 nt3.22□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 DIA2YOR080W 2199 nt3.22□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 RPL14BYHL001W 417 nt3.22□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 YPR099CYPR099C 357 nt3.22□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 OSW7YFR039C 1533 nt3.22□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 AIM9YER080W 1884 nt3.22□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 OSH6YKR003W 1347 nt3.21□□□□□ -1.89
HRQ1Q05549 YDL242WYDL242W 354 nt3.21□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.5 ms