Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX5P48382 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX5P48382 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX5P48382 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX5P48382 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX5P48382 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX5P48382 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX5P48382 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX5P48382 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX5P48382 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX5P48382 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX5P48382 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX5P48382 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX5P48382 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX5P48382 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX5P48382 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX5P48382 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX5P48382 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX5P48382 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX5P48382 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX5P48382 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX5P48382 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX5P48382 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX5P48382 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX5P48382 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX5P48382 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX5P48382 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX5P48382 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX5P48382 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RFX5P48382 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RFX5P48382 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RFX5P48382 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX5P48382 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX5P48382 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX5P48382 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX5P48382 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX5P48382 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX5P48382 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX5P48382 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX5P48382 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX5P48382 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX5P48382 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX5P48382 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX5P48382 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX5P48382 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX5P48382 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX5P48382 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX5P48382 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX5P48382 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX5P48382 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX5P48382 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX5P48382 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX5P48382 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX5P48382 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX5P48382 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX5P48382 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX5P48382 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX5P48382 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX5P48382 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX5P48382 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX5P48382 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX5P48382 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX5P48382 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX5P48382 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX5P48382 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX5P48382 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX5P48382 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX5P48382 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX5P48382 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX5P48382 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX5P48382 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX5P48382 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX5P48382 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX5P48382 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX5P48382 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX5P48382 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX5P48382 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX5P48382 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX5P48382 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX5P48382 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX5P48382 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX5P48382 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX5P48382 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX5P48382 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX5P48382 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX5P48382 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX5P48382 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX5P48382 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX5P48382 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX5P48382 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX5P48382 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX5P48382 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX5P48382 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFX5P48382 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFX5P48382 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFX5P48382 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFX5P48382 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFX5P48382 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFX5P48382 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFX5P48382 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms