Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms