Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VimP20152 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VimP20152 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VimP20152 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VimP20152 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VimP20152 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VimP20152 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VimP20152 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VimP20152 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VimP20152 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VimP20152 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VimP20152 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VimP20152 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VimP20152 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VimP20152 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VimP20152 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VimP20152 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VimP20152 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VimP20152 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VimP20152 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VimP20152 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VimP20152 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VimP20152 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VimP20152 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VimP20152 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VimP20152 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VimP20152 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VimP20152 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VimP20152 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VimP20152 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VimP20152 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VimP20152 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VimP20152 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VimP20152 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VimP20152 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VimP20152 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VimP20152 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VimP20152 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VimP20152 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VimP20152 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VimP20152 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VimP20152 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VimP20152 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VimP20152 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VimP20152 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VimP20152 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VimP20152 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VimP20152 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VimP20152 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VimP20152 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VimP20152 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VimP20152 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VimP20152 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VimP20152 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VimP20152 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VimP20152 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VimP20152 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VimP20152 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VimP20152 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VimP20152 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VimP20152 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VimP20152 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VimP20152 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VimP20152 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VimP20152 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VimP20152 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VimP20152 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VimP20152 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VimP20152 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VimP20152 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VimP20152 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VimP20152 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VimP20152 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VimP20152 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VimP20152 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VimP20152 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VimP20152 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VimP20152 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VimP20152 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VimP20152 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VimP20152 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VimP20152 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VimP20152 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VimP20152 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VimP20152 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VimP20152 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VimP20152 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VimP20152 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VimP20152 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VimP20152 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VimP20152 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VimP20152 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VimP20152 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VimP20152 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VimP20152 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VimP20152 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VimP20152 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VimP20152 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VimP20152 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VimP20152 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms