Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NSD2O96028 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NSD2O96028 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSD2O96028 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSD2O96028 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSD2O96028 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSD2O96028 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSD2O96028 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSD2O96028 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSD2O96028 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSD2O96028 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSD2O96028 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSD2O96028 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSD2O96028 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NSD2O96028 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSD2O96028 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSD2O96028 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NSD2O96028 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSD2O96028 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSD2O96028 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSD2O96028 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSD2O96028 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSD2O96028 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NSD2O96028 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NSD2O96028 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NSD2O96028 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NSD2O96028 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NSD2O96028 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NSD2O96028 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NSD2O96028 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NSD2O96028 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSD2O96028 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSD2O96028 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSD2O96028 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSD2O96028 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSD2O96028 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSD2O96028 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSD2O96028 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NSD2O96028 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSD2O96028 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSD2O96028 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSD2O96028 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSD2O96028 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSD2O96028 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSD2O96028 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSD2O96028 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSD2O96028 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSD2O96028 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSD2O96028 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD2O96028 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD2O96028 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD2O96028 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD2O96028 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD2O96028 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD2O96028 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD2O96028 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD2O96028 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD2O96028 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD2O96028 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD2O96028 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD2O96028 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD2O96028 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD2O96028 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD2O96028 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD2O96028 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD2O96028 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD2O96028 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD2O96028 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD2O96028 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD2O96028 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD2O96028 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD2O96028 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD2O96028 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD2O96028 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD2O96028 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD2O96028 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD2O96028 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD2O96028 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD2O96028 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD2O96028 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD2O96028 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD2O96028 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD2O96028 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD2O96028 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD2O96028 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD2O96028 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD2O96028 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD2O96028 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD2O96028 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD2O96028 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD2O96028 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD2O96028 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD2O96028 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD2O96028 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD2O96028 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD2O96028 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD2O96028 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD2O96028 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD2O96028 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD2O96028 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms