Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn20O55082 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn20O55082 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms