Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2K7ER74 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2K7ER74 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms