Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA8SH3BPF8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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