Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Crlf3Q9Z2L7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Crlf3Q9Z2L7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Crlf3Q9Z2L7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Crlf3Q9Z2L7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Crlf3Q9Z2L7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Crlf3Q9Z2L7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Crlf3Q9Z2L7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Crlf3Q9Z2L7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Crlf3Q9Z2L7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Crlf3Q9Z2L7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Crlf3Q9Z2L7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Crlf3Q9Z2L7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Crlf3Q9Z2L7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Crlf3Q9Z2L7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Crlf3Q9Z2L7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Crlf3Q9Z2L7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Crlf3Q9Z2L7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Crlf3Q9Z2L7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Crlf3Q9Z2L7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Crlf3Q9Z2L7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Crlf3Q9Z2L7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Crlf3Q9Z2L7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Crlf3Q9Z2L7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crlf3Q9Z2L7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crlf3Q9Z2L7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crlf3Q9Z2L7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crlf3Q9Z2L7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crlf3Q9Z2L7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crlf3Q9Z2L7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Crlf3Q9Z2L7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Crlf3Q9Z2L7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Crlf3Q9Z2L7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Crlf3Q9Z2L7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Crlf3Q9Z2L7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Crlf3Q9Z2L7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Crlf3Q9Z2L7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Crlf3Q9Z2L7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crlf3Q9Z2L7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Crlf3Q9Z2L7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Crlf3Q9Z2L7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Crlf3Q9Z2L7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Crlf3Q9Z2L7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Crlf3Q9Z2L7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crlf3Q9Z2L7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Crlf3Q9Z2L7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Crlf3Q9Z2L7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Crlf3Q9Z2L7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Crlf3Q9Z2L7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crlf3Q9Z2L7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crlf3Q9Z2L7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crlf3Q9Z2L7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crlf3Q9Z2L7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crlf3Q9Z2L7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Crlf3Q9Z2L7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Crlf3Q9Z2L7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Crlf3Q9Z2L7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Crlf3Q9Z2L7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crlf3Q9Z2L7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crlf3Q9Z2L7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crlf3Q9Z2L7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Crlf3Q9Z2L7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Crlf3Q9Z2L7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Crlf3Q9Z2L7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Crlf3Q9Z2L7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crlf3Q9Z2L7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crlf3Q9Z2L7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Crlf3Q9Z2L7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crlf3Q9Z2L7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Crlf3Q9Z2L7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crlf3Q9Z2L7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crlf3Q9Z2L7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crlf3Q9Z2L7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crlf3Q9Z2L7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crlf3Q9Z2L7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crlf3Q9Z2L7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crlf3Q9Z2L7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crlf3Q9Z2L7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Crlf3Q9Z2L7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Crlf3Q9Z2L7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Crlf3Q9Z2L7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Crlf3Q9Z2L7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Crlf3Q9Z2L7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Crlf3Q9Z2L7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Crlf3Q9Z2L7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crlf3Q9Z2L7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crlf3Q9Z2L7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crlf3Q9Z2L7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crlf3Q9Z2L7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crlf3Q9Z2L7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crlf3Q9Z2L7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Crlf3Q9Z2L7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Crlf3Q9Z2L7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Crlf3Q9Z2L7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Crlf3Q9Z2L7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Crlf3Q9Z2L7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Crlf3Q9Z2L7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Crlf3Q9Z2L7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Crlf3Q9Z2L7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms