Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gipc2Q9Z2H7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gipc2Q9Z2H7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gipc2Q9Z2H7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gipc2Q9Z2H7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gipc2Q9Z2H7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gipc2Q9Z2H7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gipc2Q9Z2H7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gipc2Q9Z2H7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gipc2Q9Z2H7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gipc2Q9Z2H7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gipc2Q9Z2H7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gipc2Q9Z2H7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gipc2Q9Z2H7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gipc2Q9Z2H7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gipc2Q9Z2H7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gipc2Q9Z2H7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms