Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E2

Chrd, Chordin, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrdQ9Z0E2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChrdQ9Z0E2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChrdQ9Z0E2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChrdQ9Z0E2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChrdQ9Z0E2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChrdQ9Z0E2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChrdQ9Z0E2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChrdQ9Z0E2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChrdQ9Z0E2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChrdQ9Z0E2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChrdQ9Z0E2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChrdQ9Z0E2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChrdQ9Z0E2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChrdQ9Z0E2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChrdQ9Z0E2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChrdQ9Z0E2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChrdQ9Z0E2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChrdQ9Z0E2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChrdQ9Z0E2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChrdQ9Z0E2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChrdQ9Z0E2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChrdQ9Z0E2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChrdQ9Z0E2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChrdQ9Z0E2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChrdQ9Z0E2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChrdQ9Z0E2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChrdQ9Z0E2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChrdQ9Z0E2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChrdQ9Z0E2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChrdQ9Z0E2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChrdQ9Z0E2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChrdQ9Z0E2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChrdQ9Z0E2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChrdQ9Z0E2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChrdQ9Z0E2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChrdQ9Z0E2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChrdQ9Z0E2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChrdQ9Z0E2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChrdQ9Z0E2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChrdQ9Z0E2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChrdQ9Z0E2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChrdQ9Z0E2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChrdQ9Z0E2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChrdQ9Z0E2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChrdQ9Z0E2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChrdQ9Z0E2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChrdQ9Z0E2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChrdQ9Z0E2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChrdQ9Z0E2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChrdQ9Z0E2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChrdQ9Z0E2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChrdQ9Z0E2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChrdQ9Z0E2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChrdQ9Z0E2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChrdQ9Z0E2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChrdQ9Z0E2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChrdQ9Z0E2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChrdQ9Z0E2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ChrdQ9Z0E2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChrdQ9Z0E2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChrdQ9Z0E2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ChrdQ9Z0E2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ChrdQ9Z0E2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChrdQ9Z0E2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ChrdQ9Z0E2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ChrdQ9Z0E2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChrdQ9Z0E2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChrdQ9Z0E2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChrdQ9Z0E2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChrdQ9Z0E2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChrdQ9Z0E2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChrdQ9Z0E2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChrdQ9Z0E2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChrdQ9Z0E2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChrdQ9Z0E2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChrdQ9Z0E2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChrdQ9Z0E2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChrdQ9Z0E2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChrdQ9Z0E2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChrdQ9Z0E2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChrdQ9Z0E2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChrdQ9Z0E2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ChrdQ9Z0E2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChrdQ9Z0E2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChrdQ9Z0E2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChrdQ9Z0E2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChrdQ9Z0E2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChrdQ9Z0E2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChrdQ9Z0E2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChrdQ9Z0E2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChrdQ9Z0E2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChrdQ9Z0E2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChrdQ9Z0E2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChrdQ9Z0E2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChrdQ9Z0E2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChrdQ9Z0E2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChrdQ9Z0E2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChrdQ9Z0E2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChrdQ9Z0E2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChrdQ9Z0E2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms