Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV76

Ap4b1, AP-4 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4b1Q9WV76 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap4b1Q9WV76 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap4b1Q9WV76 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap4b1Q9WV76 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap4b1Q9WV76 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap4b1Q9WV76 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap4b1Q9WV76 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap4b1Q9WV76 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap4b1Q9WV76 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap4b1Q9WV76 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap4b1Q9WV76 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap4b1Q9WV76 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ap4b1Q9WV76 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ap4b1Q9WV76 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ap4b1Q9WV76 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ap4b1Q9WV76 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ap4b1Q9WV76 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap4b1Q9WV76 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap4b1Q9WV76 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap4b1Q9WV76 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ap4b1Q9WV76 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ap4b1Q9WV76 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap4b1Q9WV76 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap4b1Q9WV76 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap4b1Q9WV76 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap4b1Q9WV76 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap4b1Q9WV76 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ap4b1Q9WV76 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ap4b1Q9WV76 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ap4b1Q9WV76 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ap4b1Q9WV76 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ap4b1Q9WV76 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap4b1Q9WV76 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap4b1Q9WV76 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap4b1Q9WV76 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap4b1Q9WV76 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap4b1Q9WV76 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap4b1Q9WV76 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap4b1Q9WV76 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap4b1Q9WV76 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap4b1Q9WV76 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap4b1Q9WV76 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap4b1Q9WV76 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap4b1Q9WV76 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap4b1Q9WV76 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap4b1Q9WV76 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap4b1Q9WV76 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap4b1Q9WV76 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap4b1Q9WV76 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap4b1Q9WV76 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap4b1Q9WV76 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ap4b1Q9WV76 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ap4b1Q9WV76 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap4b1Q9WV76 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap4b1Q9WV76 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap4b1Q9WV76 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap4b1Q9WV76 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap4b1Q9WV76 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap4b1Q9WV76 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap4b1Q9WV76 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap4b1Q9WV76 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap4b1Q9WV76 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap4b1Q9WV76 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap4b1Q9WV76 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ap4b1Q9WV76 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ap4b1Q9WV76 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ap4b1Q9WV76 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ap4b1Q9WV76 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ap4b1Q9WV76 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ap4b1Q9WV76 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap4b1Q9WV76 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap4b1Q9WV76 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap4b1Q9WV76 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap4b1Q9WV76 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap4b1Q9WV76 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap4b1Q9WV76 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap4b1Q9WV76 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap4b1Q9WV76 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap4b1Q9WV76 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap4b1Q9WV76 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap4b1Q9WV76 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap4b1Q9WV76 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap4b1Q9WV76 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap4b1Q9WV76 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap4b1Q9WV76 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap4b1Q9WV76 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap4b1Q9WV76 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap4b1Q9WV76 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap4b1Q9WV76 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap4b1Q9WV76 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ap4b1Q9WV76 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap4b1Q9WV76 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap4b1Q9WV76 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap4b1Q9WV76 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap4b1Q9WV76 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap4b1Q9WV76 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ap4b1Q9WV76 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap4b1Q9WV76 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap4b1Q9WV76 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap4b1Q9WV76 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms