Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Opn3Q9WUK7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Opn3Q9WUK7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Opn3Q9WUK7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Opn3Q9WUK7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Opn3Q9WUK7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Opn3Q9WUK7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Opn3Q9WUK7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Opn3Q9WUK7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Opn3Q9WUK7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Opn3Q9WUK7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Opn3Q9WUK7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Opn3Q9WUK7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Opn3Q9WUK7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Opn3Q9WUK7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Opn3Q9WUK7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn3Q9WUK7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn3Q9WUK7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn3Q9WUK7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Opn3Q9WUK7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Opn3Q9WUK7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Opn3Q9WUK7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Opn3Q9WUK7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Opn3Q9WUK7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Opn3Q9WUK7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Opn3Q9WUK7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Opn3Q9WUK7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Opn3Q9WUK7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Opn3Q9WUK7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Opn3Q9WUK7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Opn3Q9WUK7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Opn3Q9WUK7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Opn3Q9WUK7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Opn3Q9WUK7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Opn3Q9WUK7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Opn3Q9WUK7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Opn3Q9WUK7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Opn3Q9WUK7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Opn3Q9WUK7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Opn3Q9WUK7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Opn3Q9WUK7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Opn3Q9WUK7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Opn3Q9WUK7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Opn3Q9WUK7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Opn3Q9WUK7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Opn3Q9WUK7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Opn3Q9WUK7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Opn3Q9WUK7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Opn3Q9WUK7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Opn3Q9WUK7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Opn3Q9WUK7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Opn3Q9WUK7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Opn3Q9WUK7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Opn3Q9WUK7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Opn3Q9WUK7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Opn3Q9WUK7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Opn3Q9WUK7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn3Q9WUK7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn3Q9WUK7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Opn3Q9WUK7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Opn3Q9WUK7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Opn3Q9WUK7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Opn3Q9WUK7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn3Q9WUK7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn3Q9WUK7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn3Q9WUK7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn3Q9WUK7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn3Q9WUK7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn3Q9WUK7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn3Q9WUK7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn3Q9WUK7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn3Q9WUK7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn3Q9WUK7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Opn3Q9WUK7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Opn3Q9WUK7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Opn3Q9WUK7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn3Q9WUK7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn3Q9WUK7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn3Q9WUK7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn3Q9WUK7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Opn3Q9WUK7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Opn3Q9WUK7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Opn3Q9WUK7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Opn3Q9WUK7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Opn3Q9WUK7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn3Q9WUK7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn3Q9WUK7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn3Q9WUK7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn3Q9WUK7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn3Q9WUK7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn3Q9WUK7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn3Q9WUK7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn3Q9WUK7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn3Q9WUK7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn3Q9WUK7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn3Q9WUK7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn3Q9WUK7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn3Q9WUK7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn3Q9WUK7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn3Q9WUK7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms