Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lhx9Q9WUH2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lhx9Q9WUH2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lhx9Q9WUH2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lhx9Q9WUH2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lhx9Q9WUH2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lhx9Q9WUH2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lhx9Q9WUH2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lhx9Q9WUH2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lhx9Q9WUH2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lhx9Q9WUH2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lhx9Q9WUH2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lhx9Q9WUH2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lhx9Q9WUH2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lhx9Q9WUH2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lhx9Q9WUH2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lhx9Q9WUH2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lhx9Q9WUH2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lhx9Q9WUH2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lhx9Q9WUH2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lhx9Q9WUH2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lhx9Q9WUH2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lhx9Q9WUH2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lhx9Q9WUH2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lhx9Q9WUH2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lhx9Q9WUH2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lhx9Q9WUH2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lhx9Q9WUH2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lhx9Q9WUH2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lhx9Q9WUH2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lhx9Q9WUH2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lhx9Q9WUH2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lhx9Q9WUH2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lhx9Q9WUH2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lhx9Q9WUH2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lhx9Q9WUH2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lhx9Q9WUH2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lhx9Q9WUH2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lhx9Q9WUH2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lhx9Q9WUH2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lhx9Q9WUH2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lhx9Q9WUH2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lhx9Q9WUH2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lhx9Q9WUH2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lhx9Q9WUH2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lhx9Q9WUH2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lhx9Q9WUH2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lhx9Q9WUH2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lhx9Q9WUH2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lhx9Q9WUH2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lhx9Q9WUH2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lhx9Q9WUH2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lhx9Q9WUH2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lhx9Q9WUH2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lhx9Q9WUH2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lhx9Q9WUH2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lhx9Q9WUH2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lhx9Q9WUH2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lhx9Q9WUH2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lhx9Q9WUH2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lhx9Q9WUH2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lhx9Q9WUH2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lhx9Q9WUH2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lhx9Q9WUH2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lhx9Q9WUH2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lhx9Q9WUH2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lhx9Q9WUH2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lhx9Q9WUH2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lhx9Q9WUH2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lhx9Q9WUH2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lhx9Q9WUH2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lhx9Q9WUH2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lhx9Q9WUH2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lhx9Q9WUH2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lhx9Q9WUH2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lhx9Q9WUH2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lhx9Q9WUH2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lhx9Q9WUH2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lhx9Q9WUH2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lhx9Q9WUH2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lhx9Q9WUH2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lhx9Q9WUH2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lhx9Q9WUH2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lhx9Q9WUH2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lhx9Q9WUH2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lhx9Q9WUH2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lhx9Q9WUH2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lhx9Q9WUH2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lhx9Q9WUH2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lhx9Q9WUH2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lhx9Q9WUH2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lhx9Q9WUH2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lhx9Q9WUH2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lhx9Q9WUH2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lhx9Q9WUH2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lhx9Q9WUH2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lhx9Q9WUH2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lhx9Q9WUH2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lhx9Q9WUH2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lhx9Q9WUH2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms