Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pdcd6ipQ9WU78 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pdcd6ipQ9WU78 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pdcd6ipQ9WU78 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pdcd6ipQ9WU78 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pdcd6ipQ9WU78 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdcd6ipQ9WU78 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdcd6ipQ9WU78 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdcd6ipQ9WU78 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdcd6ipQ9WU78 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdcd6ipQ9WU78 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdcd6ipQ9WU78 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pdcd6ipQ9WU78 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pdcd6ipQ9WU78 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pdcd6ipQ9WU78 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pdcd6ipQ9WU78 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pdcd6ipQ9WU78 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdcd6ipQ9WU78 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdcd6ipQ9WU78 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pdcd6ipQ9WU78 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdcd6ipQ9WU78 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdcd6ipQ9WU78 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdcd6ipQ9WU78 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdcd6ipQ9WU78 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdcd6ipQ9WU78 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Pdcd6ipQ9WU78 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pdcd6ipQ9WU78 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pdcd6ipQ9WU78 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pdcd6ipQ9WU78 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Pdcd6ipQ9WU78 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pdcd6ipQ9WU78 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdcd6ipQ9WU78 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pdcd6ipQ9WU78 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Pdcd6ipQ9WU78 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pdcd6ipQ9WU78 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pdcd6ipQ9WU78 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pdcd6ipQ9WU78 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pdcd6ipQ9WU78 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdcd6ipQ9WU78 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdcd6ipQ9WU78 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdcd6ipQ9WU78 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdcd6ipQ9WU78 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdcd6ipQ9WU78 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pdcd6ipQ9WU78 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pdcd6ipQ9WU78 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Pdcd6ipQ9WU78 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pdcd6ipQ9WU78 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pdcd6ipQ9WU78 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pdcd6ipQ9WU78 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdcd6ipQ9WU78 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdcd6ipQ9WU78 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pdcd6ipQ9WU78 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pdcd6ipQ9WU78 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pdcd6ipQ9WU78 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pdcd6ipQ9WU78 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pdcd6ipQ9WU78 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pdcd6ipQ9WU78 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pdcd6ipQ9WU78 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pdcd6ipQ9WU78 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pdcd6ipQ9WU78 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pdcd6ipQ9WU78 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pdcd6ipQ9WU78 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pdcd6ipQ9WU78 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pdcd6ipQ9WU78 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pdcd6ipQ9WU78 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pdcd6ipQ9WU78 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pdcd6ipQ9WU78 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pdcd6ipQ9WU78 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pdcd6ipQ9WU78 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pdcd6ipQ9WU78 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pdcd6ipQ9WU78 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pdcd6ipQ9WU78 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pdcd6ipQ9WU78 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdcd6ipQ9WU78 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pdcd6ipQ9WU78 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pdcd6ipQ9WU78 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pdcd6ipQ9WU78 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdcd6ipQ9WU78 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdcd6ipQ9WU78 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdcd6ipQ9WU78 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdcd6ipQ9WU78 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdcd6ipQ9WU78 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdcd6ipQ9WU78 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdcd6ipQ9WU78 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdcd6ipQ9WU78 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdcd6ipQ9WU78 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdcd6ipQ9WU78 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdcd6ipQ9WU78 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdcd6ipQ9WU78 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pdcd6ipQ9WU78 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdcd6ipQ9WU78 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdcd6ipQ9WU78 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pdcd6ipQ9WU78 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pdcd6ipQ9WU78 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pdcd6ipQ9WU78 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pdcd6ipQ9WU78 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms