Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU60

Atrn, Attractin, mousemouse

Predictions only

Length 1,428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrnQ9WU60 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
AtrnQ9WU60 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
AtrnQ9WU60 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
AtrnQ9WU60 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
AtrnQ9WU60 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
AtrnQ9WU60 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
AtrnQ9WU60 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
AtrnQ9WU60 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
AtrnQ9WU60 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
AtrnQ9WU60 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
AtrnQ9WU60 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
AtrnQ9WU60 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
AtrnQ9WU60 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
AtrnQ9WU60 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
AtrnQ9WU60 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
AtrnQ9WU60 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
AtrnQ9WU60 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
AtrnQ9WU60 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
AtrnQ9WU60 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
AtrnQ9WU60 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
AtrnQ9WU60 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
AtrnQ9WU60 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
AtrnQ9WU60 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
AtrnQ9WU60 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
AtrnQ9WU60 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
AtrnQ9WU60 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
AtrnQ9WU60 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC31.32■■■□□ 2.61
AtrnQ9WU60 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
AtrnQ9WU60 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
AtrnQ9WU60 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
AtrnQ9WU60 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
AtrnQ9WU60 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
AtrnQ9WU60 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
AtrnQ9WU60 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
AtrnQ9WU60 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
AtrnQ9WU60 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
AtrnQ9WU60 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
AtrnQ9WU60 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
AtrnQ9WU60 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
AtrnQ9WU60 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
AtrnQ9WU60 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
AtrnQ9WU60 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
AtrnQ9WU60 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
AtrnQ9WU60 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
AtrnQ9WU60 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
AtrnQ9WU60 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
AtrnQ9WU60 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
AtrnQ9WU60 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
AtrnQ9WU60 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
AtrnQ9WU60 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
AtrnQ9WU60 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
AtrnQ9WU60 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
AtrnQ9WU60 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
AtrnQ9WU60 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
AtrnQ9WU60 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
AtrnQ9WU60 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
AtrnQ9WU60 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
AtrnQ9WU60 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
AtrnQ9WU60 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
AtrnQ9WU60 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
AtrnQ9WU60 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
AtrnQ9WU60 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
AtrnQ9WU60 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
AtrnQ9WU60 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
AtrnQ9WU60 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
AtrnQ9WU60 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
AtrnQ9WU60 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
AtrnQ9WU60 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
AtrnQ9WU60 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
AtrnQ9WU60 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
AtrnQ9WU60 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
AtrnQ9WU60 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
AtrnQ9WU60 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
AtrnQ9WU60 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
AtrnQ9WU60 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
AtrnQ9WU60 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
AtrnQ9WU60 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
AtrnQ9WU60 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
AtrnQ9WU60 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
AtrnQ9WU60 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
AtrnQ9WU60 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
AtrnQ9WU60 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
AtrnQ9WU60 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
AtrnQ9WU60 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
AtrnQ9WU60 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC31■■■□□ 2.55
AtrnQ9WU60 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC31■■■□□ 2.55
AtrnQ9WU60 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
AtrnQ9WU60 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
AtrnQ9WU60 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
AtrnQ9WU60 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC31■■■□□ 2.55
AtrnQ9WU60 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC31■■■□□ 2.55
AtrnQ9WU60 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
AtrnQ9WU60 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
AtrnQ9WU60 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
AtrnQ9WU60 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
AtrnQ9WU60 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
AtrnQ9WU60 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
AtrnQ9WU60 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
AtrnQ9WU60 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
AtrnQ9WU60 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms