Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ03

Slc39a1, Zinc transporter ZIP1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc39a1Q9QZ03 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc39a1Q9QZ03 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc39a1Q9QZ03 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc39a1Q9QZ03 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc39a1Q9QZ03 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc39a1Q9QZ03 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc39a1Q9QZ03 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc39a1Q9QZ03 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc39a1Q9QZ03 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc39a1Q9QZ03 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc39a1Q9QZ03 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc39a1Q9QZ03 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc39a1Q9QZ03 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc39a1Q9QZ03 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc39a1Q9QZ03 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc39a1Q9QZ03 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc39a1Q9QZ03 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc39a1Q9QZ03 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc39a1Q9QZ03 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc39a1Q9QZ03 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc39a1Q9QZ03 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc39a1Q9QZ03 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc39a1Q9QZ03 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc39a1Q9QZ03 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc39a1Q9QZ03 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc39a1Q9QZ03 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc39a1Q9QZ03 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc39a1Q9QZ03 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc39a1Q9QZ03 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc39a1Q9QZ03 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc39a1Q9QZ03 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc39a1Q9QZ03 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc39a1Q9QZ03 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc39a1Q9QZ03 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc39a1Q9QZ03 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc39a1Q9QZ03 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc39a1Q9QZ03 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc39a1Q9QZ03 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc39a1Q9QZ03 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc39a1Q9QZ03 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc39a1Q9QZ03 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc39a1Q9QZ03 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc39a1Q9QZ03 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc39a1Q9QZ03 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc39a1Q9QZ03 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc39a1Q9QZ03 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc39a1Q9QZ03 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc39a1Q9QZ03 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc39a1Q9QZ03 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc39a1Q9QZ03 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc39a1Q9QZ03 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc39a1Q9QZ03 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc39a1Q9QZ03 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc39a1Q9QZ03 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc39a1Q9QZ03 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc39a1Q9QZ03 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc39a1Q9QZ03 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc39a1Q9QZ03 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc39a1Q9QZ03 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc39a1Q9QZ03 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc39a1Q9QZ03 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc39a1Q9QZ03 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc39a1Q9QZ03 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc39a1Q9QZ03 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc39a1Q9QZ03 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc39a1Q9QZ03 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc39a1Q9QZ03 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc39a1Q9QZ03 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc39a1Q9QZ03 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc39a1Q9QZ03 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc39a1Q9QZ03 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc39a1Q9QZ03 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc39a1Q9QZ03 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc39a1Q9QZ03 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc39a1Q9QZ03 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc39a1Q9QZ03 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc39a1Q9QZ03 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc39a1Q9QZ03 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slc39a1Q9QZ03 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc39a1Q9QZ03 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc39a1Q9QZ03 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc39a1Q9QZ03 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc39a1Q9QZ03 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc39a1Q9QZ03 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc39a1Q9QZ03 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc39a1Q9QZ03 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc39a1Q9QZ03 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc39a1Q9QZ03 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc39a1Q9QZ03 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc39a1Q9QZ03 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc39a1Q9QZ03 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc39a1Q9QZ03 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc39a1Q9QZ03 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc39a1Q9QZ03 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc39a1Q9QZ03 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc39a1Q9QZ03 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc39a1Q9QZ03 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc39a1Q9QZ03 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc39a1Q9QZ03 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc39a1Q9QZ03 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms