Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SpastQ9QYY8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SpastQ9QYY8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SpastQ9QYY8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SpastQ9QYY8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SpastQ9QYY8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SpastQ9QYY8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SpastQ9QYY8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SpastQ9QYY8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SpastQ9QYY8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SpastQ9QYY8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SpastQ9QYY8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SpastQ9QYY8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SpastQ9QYY8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SpastQ9QYY8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SpastQ9QYY8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SpastQ9QYY8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SpastQ9QYY8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SpastQ9QYY8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SpastQ9QYY8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SpastQ9QYY8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SpastQ9QYY8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SpastQ9QYY8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SpastQ9QYY8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SpastQ9QYY8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SpastQ9QYY8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SpastQ9QYY8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SpastQ9QYY8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SpastQ9QYY8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SpastQ9QYY8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SpastQ9QYY8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SpastQ9QYY8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SpastQ9QYY8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SpastQ9QYY8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SpastQ9QYY8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SpastQ9QYY8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SpastQ9QYY8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SpastQ9QYY8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SpastQ9QYY8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpastQ9QYY8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpastQ9QYY8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpastQ9QYY8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpastQ9QYY8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpastQ9QYY8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpastQ9QYY8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpastQ9QYY8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpastQ9QYY8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpastQ9QYY8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SpastQ9QYY8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SpastQ9QYY8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SpastQ9QYY8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SpastQ9QYY8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SpastQ9QYY8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SpastQ9QYY8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SpastQ9QYY8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SpastQ9QYY8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SpastQ9QYY8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SpastQ9QYY8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpastQ9QYY8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpastQ9QYY8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpastQ9QYY8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SpastQ9QYY8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SpastQ9QYY8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpastQ9QYY8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SpastQ9QYY8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SpastQ9QYY8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SpastQ9QYY8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SpastQ9QYY8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SpastQ9QYY8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SpastQ9QYY8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SpastQ9QYY8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SpastQ9QYY8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SpastQ9QYY8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SpastQ9QYY8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SpastQ9QYY8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SpastQ9QYY8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SpastQ9QYY8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SpastQ9QYY8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SpastQ9QYY8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SpastQ9QYY8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SpastQ9QYY8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SpastQ9QYY8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SpastQ9QYY8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SpastQ9QYY8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpastQ9QYY8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpastQ9QYY8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpastQ9QYY8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpastQ9QYY8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpastQ9QYY8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SpastQ9QYY8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SpastQ9QYY8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SpastQ9QYY8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SpastQ9QYY8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SpastQ9QYY8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SpastQ9QYY8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SpastQ9QYY8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SpastQ9QYY8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SpastQ9QYY8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SpastQ9QYY8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SpastQ9QYY8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms