Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VapbQ9QY76 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VapbQ9QY76 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VapbQ9QY76 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VapbQ9QY76 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VapbQ9QY76 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VapbQ9QY76 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VapbQ9QY76 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VapbQ9QY76 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VapbQ9QY76 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VapbQ9QY76 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VapbQ9QY76 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VapbQ9QY76 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VapbQ9QY76 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VapbQ9QY76 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VapbQ9QY76 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VapbQ9QY76 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VapbQ9QY76 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VapbQ9QY76 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VapbQ9QY76 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VapbQ9QY76 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VapbQ9QY76 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VapbQ9QY76 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VapbQ9QY76 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VapbQ9QY76 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VapbQ9QY76 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VapbQ9QY76 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VapbQ9QY76 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VapbQ9QY76 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VapbQ9QY76 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VapbQ9QY76 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VapbQ9QY76 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VapbQ9QY76 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VapbQ9QY76 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VapbQ9QY76 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VapbQ9QY76 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VapbQ9QY76 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VapbQ9QY76 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VapbQ9QY76 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VapbQ9QY76 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VapbQ9QY76 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VapbQ9QY76 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VapbQ9QY76 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VapbQ9QY76 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VapbQ9QY76 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VapbQ9QY76 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VapbQ9QY76 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VapbQ9QY76 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VapbQ9QY76 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VapbQ9QY76 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VapbQ9QY76 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VapbQ9QY76 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VapbQ9QY76 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VapbQ9QY76 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VapbQ9QY76 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VapbQ9QY76 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VapbQ9QY76 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VapbQ9QY76 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VapbQ9QY76 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VapbQ9QY76 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VapbQ9QY76 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VapbQ9QY76 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VapbQ9QY76 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VapbQ9QY76 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VapbQ9QY76 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VapbQ9QY76 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VapbQ9QY76 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VapbQ9QY76 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VapbQ9QY76 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VapbQ9QY76 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VapbQ9QY76 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VapbQ9QY76 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VapbQ9QY76 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VapbQ9QY76 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VapbQ9QY76 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VapbQ9QY76 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VapbQ9QY76 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VapbQ9QY76 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VapbQ9QY76 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VapbQ9QY76 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VapbQ9QY76 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VapbQ9QY76 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VapbQ9QY76 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VapbQ9QY76 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VapbQ9QY76 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VapbQ9QY76 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VapbQ9QY76 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VapbQ9QY76 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VapbQ9QY76 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VapbQ9QY76 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VapbQ9QY76 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VapbQ9QY76 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VapbQ9QY76 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VapbQ9QY76 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VapbQ9QY76 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VapbQ9QY76 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VapbQ9QY76 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VapbQ9QY76 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VapbQ9QY76 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VapbQ9QY76 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms