Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdzd4Q9QY39 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdzd4Q9QY39 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdzd4Q9QY39 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdzd4Q9QY39 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdzd4Q9QY39 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdzd4Q9QY39 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdzd4Q9QY39 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdzd4Q9QY39 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdzd4Q9QY39 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdzd4Q9QY39 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdzd4Q9QY39 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdzd4Q9QY39 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdzd4Q9QY39 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdzd4Q9QY39 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdzd4Q9QY39 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdzd4Q9QY39 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdzd4Q9QY39 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdzd4Q9QY39 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdzd4Q9QY39 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdzd4Q9QY39 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdzd4Q9QY39 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdzd4Q9QY39 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdzd4Q9QY39 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdzd4Q9QY39 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdzd4Q9QY39 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzd4Q9QY39 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdzd4Q9QY39 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdzd4Q9QY39 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdzd4Q9QY39 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdzd4Q9QY39 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdzd4Q9QY39 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdzd4Q9QY39 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdzd4Q9QY39 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdzd4Q9QY39 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdzd4Q9QY39 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pdzd4Q9QY39 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Pdzd4Q9QY39 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Pdzd4Q9QY39 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdzd4Q9QY39 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdzd4Q9QY39 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdzd4Q9QY39 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdzd4Q9QY39 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdzd4Q9QY39 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdzd4Q9QY39 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pdzd4Q9QY39 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdzd4Q9QY39 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdzd4Q9QY39 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdzd4Q9QY39 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdzd4Q9QY39 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdzd4Q9QY39 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdzd4Q9QY39 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdzd4Q9QY39 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdzd4Q9QY39 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdzd4Q9QY39 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdzd4Q9QY39 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdzd4Q9QY39 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdzd4Q9QY39 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdzd4Q9QY39 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdzd4Q9QY39 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdzd4Q9QY39 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdzd4Q9QY39 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdzd4Q9QY39 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdzd4Q9QY39 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdzd4Q9QY39 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdzd4Q9QY39 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdzd4Q9QY39 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pdzd4Q9QY39 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pdzd4Q9QY39 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdzd4Q9QY39 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdzd4Q9QY39 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdzd4Q9QY39 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdzd4Q9QY39 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdzd4Q9QY39 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdzd4Q9QY39 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdzd4Q9QY39 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdzd4Q9QY39 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdzd4Q9QY39 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdzd4Q9QY39 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdzd4Q9QY39 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdzd4Q9QY39 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdzd4Q9QY39 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdzd4Q9QY39 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdzd4Q9QY39 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdzd4Q9QY39 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdzd4Q9QY39 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdzd4Q9QY39 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdzd4Q9QY39 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdzd4Q9QY39 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdzd4Q9QY39 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdzd4Q9QY39 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdzd4Q9QY39 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdzd4Q9QY39 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdzd4Q9QY39 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdzd4Q9QY39 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdzd4Q9QY39 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pdzd4Q9QY39 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pdzd4Q9QY39 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pdzd4Q9QY39 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pdzd4Q9QY39 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms