Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phc2Q9QWH1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Phc2Q9QWH1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phc2Q9QWH1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phc2Q9QWH1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phc2Q9QWH1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phc2Q9QWH1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phc2Q9QWH1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phc2Q9QWH1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phc2Q9QWH1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phc2Q9QWH1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phc2Q9QWH1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Phc2Q9QWH1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phc2Q9QWH1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Phc2Q9QWH1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phc2Q9QWH1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Phc2Q9QWH1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phc2Q9QWH1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phc2Q9QWH1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phc2Q9QWH1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phc2Q9QWH1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phc2Q9QWH1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phc2Q9QWH1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phc2Q9QWH1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phc2Q9QWH1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phc2Q9QWH1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phc2Q9QWH1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phc2Q9QWH1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phc2Q9QWH1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phc2Q9QWH1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Phc2Q9QWH1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Phc2Q9QWH1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phc2Q9QWH1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phc2Q9QWH1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Phc2Q9QWH1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Phc2Q9QWH1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phc2Q9QWH1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phc2Q9QWH1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phc2Q9QWH1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phc2Q9QWH1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phc2Q9QWH1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phc2Q9QWH1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phc2Q9QWH1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phc2Q9QWH1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phc2Q9QWH1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phc2Q9QWH1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phc2Q9QWH1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phc2Q9QWH1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phc2Q9QWH1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phc2Q9QWH1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phc2Q9QWH1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phc2Q9QWH1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phc2Q9QWH1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phc2Q9QWH1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phc2Q9QWH1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Phc2Q9QWH1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phc2Q9QWH1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phc2Q9QWH1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phc2Q9QWH1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phc2Q9QWH1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phc2Q9QWH1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phc2Q9QWH1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phc2Q9QWH1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Phc2Q9QWH1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phc2Q9QWH1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phc2Q9QWH1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phc2Q9QWH1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phc2Q9QWH1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phc2Q9QWH1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phc2Q9QWH1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phc2Q9QWH1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Phc2Q9QWH1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phc2Q9QWH1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phc2Q9QWH1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phc2Q9QWH1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phc2Q9QWH1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phc2Q9QWH1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Phc2Q9QWH1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phc2Q9QWH1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phc2Q9QWH1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phc2Q9QWH1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phc2Q9QWH1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phc2Q9QWH1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phc2Q9QWH1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phc2Q9QWH1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phc2Q9QWH1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phc2Q9QWH1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phc2Q9QWH1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phc2Q9QWH1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phc2Q9QWH1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phc2Q9QWH1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phc2Q9QWH1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Phc2Q9QWH1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phc2Q9QWH1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phc2Q9QWH1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phc2Q9QWH1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phc2Q9QWH1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phc2Q9QWH1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phc2Q9QWH1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phc2Q9QWH1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms