Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcea2Q9QVN7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcea2Q9QVN7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcea2Q9QVN7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcea2Q9QVN7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcea2Q9QVN7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcea2Q9QVN7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcea2Q9QVN7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcea2Q9QVN7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcea2Q9QVN7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcea2Q9QVN7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcea2Q9QVN7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcea2Q9QVN7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcea2Q9QVN7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcea2Q9QVN7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcea2Q9QVN7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcea2Q9QVN7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcea2Q9QVN7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcea2Q9QVN7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcea2Q9QVN7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcea2Q9QVN7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcea2Q9QVN7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcea2Q9QVN7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcea2Q9QVN7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcea2Q9QVN7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcea2Q9QVN7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcea2Q9QVN7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcea2Q9QVN7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcea2Q9QVN7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcea2Q9QVN7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcea2Q9QVN7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcea2Q9QVN7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcea2Q9QVN7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcea2Q9QVN7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcea2Q9QVN7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcea2Q9QVN7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcea2Q9QVN7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcea2Q9QVN7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcea2Q9QVN7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcea2Q9QVN7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcea2Q9QVN7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcea2Q9QVN7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tcea2Q9QVN7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcea2Q9QVN7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcea2Q9QVN7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcea2Q9QVN7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcea2Q9QVN7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcea2Q9QVN7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcea2Q9QVN7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcea2Q9QVN7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcea2Q9QVN7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcea2Q9QVN7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcea2Q9QVN7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcea2Q9QVN7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcea2Q9QVN7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcea2Q9QVN7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcea2Q9QVN7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcea2Q9QVN7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcea2Q9QVN7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcea2Q9QVN7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcea2Q9QVN7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcea2Q9QVN7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tcea2Q9QVN7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcea2Q9QVN7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcea2Q9QVN7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcea2Q9QVN7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcea2Q9QVN7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcea2Q9QVN7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcea2Q9QVN7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcea2Q9QVN7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcea2Q9QVN7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcea2Q9QVN7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcea2Q9QVN7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcea2Q9QVN7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcea2Q9QVN7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcea2Q9QVN7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcea2Q9QVN7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcea2Q9QVN7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcea2Q9QVN7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcea2Q9QVN7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcea2Q9QVN7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcea2Q9QVN7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcea2Q9QVN7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcea2Q9QVN7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcea2Q9QVN7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcea2Q9QVN7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcea2Q9QVN7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcea2Q9QVN7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcea2Q9QVN7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcea2Q9QVN7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcea2Q9QVN7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcea2Q9QVN7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcea2Q9QVN7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcea2Q9QVN7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcea2Q9QVN7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcea2Q9QVN7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcea2Q9QVN7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcea2Q9QVN7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcea2Q9QVN7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcea2Q9QVN7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms