Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnaja4Q9JMC3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnaja4Q9JMC3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnaja4Q9JMC3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnaja4Q9JMC3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnaja4Q9JMC3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnaja4Q9JMC3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnaja4Q9JMC3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnaja4Q9JMC3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnaja4Q9JMC3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnaja4Q9JMC3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnaja4Q9JMC3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnaja4Q9JMC3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnaja4Q9JMC3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnaja4Q9JMC3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnaja4Q9JMC3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnaja4Q9JMC3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnaja4Q9JMC3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnaja4Q9JMC3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnaja4Q9JMC3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnaja4Q9JMC3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnaja4Q9JMC3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnaja4Q9JMC3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnaja4Q9JMC3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnaja4Q9JMC3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnaja4Q9JMC3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnaja4Q9JMC3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Dnaja4Q9JMC3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Dnaja4Q9JMC3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnaja4Q9JMC3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnaja4Q9JMC3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnaja4Q9JMC3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnaja4Q9JMC3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnaja4Q9JMC3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnaja4Q9JMC3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnaja4Q9JMC3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnaja4Q9JMC3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnaja4Q9JMC3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnaja4Q9JMC3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnaja4Q9JMC3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnaja4Q9JMC3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnaja4Q9JMC3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnaja4Q9JMC3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnaja4Q9JMC3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnaja4Q9JMC3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnaja4Q9JMC3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnaja4Q9JMC3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnaja4Q9JMC3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnaja4Q9JMC3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnaja4Q9JMC3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaja4Q9JMC3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaja4Q9JMC3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaja4Q9JMC3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnaja4Q9JMC3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnaja4Q9JMC3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnaja4Q9JMC3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnaja4Q9JMC3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnaja4Q9JMC3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnaja4Q9JMC3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnaja4Q9JMC3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnaja4Q9JMC3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnaja4Q9JMC3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnaja4Q9JMC3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnaja4Q9JMC3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnaja4Q9JMC3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnaja4Q9JMC3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnaja4Q9JMC3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnaja4Q9JMC3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnaja4Q9JMC3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnaja4Q9JMC3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnaja4Q9JMC3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnaja4Q9JMC3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnaja4Q9JMC3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnaja4Q9JMC3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnaja4Q9JMC3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnaja4Q9JMC3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnaja4Q9JMC3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dnaja4Q9JMC3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dnaja4Q9JMC3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dnaja4Q9JMC3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dnaja4Q9JMC3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dnaja4Q9JMC3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnaja4Q9JMC3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaja4Q9JMC3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaja4Q9JMC3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaja4Q9JMC3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaja4Q9JMC3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaja4Q9JMC3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaja4Q9JMC3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaja4Q9JMC3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaja4Q9JMC3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaja4Q9JMC3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaja4Q9JMC3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaja4Q9JMC3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaja4Q9JMC3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaja4Q9JMC3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaja4Q9JMC3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaja4Q9JMC3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaja4Q9JMC3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaja4Q9JMC3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms