Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LitafQ9JLJ0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LitafQ9JLJ0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LitafQ9JLJ0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LitafQ9JLJ0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LitafQ9JLJ0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LitafQ9JLJ0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LitafQ9JLJ0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LitafQ9JLJ0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LitafQ9JLJ0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LitafQ9JLJ0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LitafQ9JLJ0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LitafQ9JLJ0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LitafQ9JLJ0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LitafQ9JLJ0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LitafQ9JLJ0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LitafQ9JLJ0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LitafQ9JLJ0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LitafQ9JLJ0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LitafQ9JLJ0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LitafQ9JLJ0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LitafQ9JLJ0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LitafQ9JLJ0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LitafQ9JLJ0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LitafQ9JLJ0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LitafQ9JLJ0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LitafQ9JLJ0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LitafQ9JLJ0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LitafQ9JLJ0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LitafQ9JLJ0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LitafQ9JLJ0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LitafQ9JLJ0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LitafQ9JLJ0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LitafQ9JLJ0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LitafQ9JLJ0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LitafQ9JLJ0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LitafQ9JLJ0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LitafQ9JLJ0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LitafQ9JLJ0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LitafQ9JLJ0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LitafQ9JLJ0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LitafQ9JLJ0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LitafQ9JLJ0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LitafQ9JLJ0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LitafQ9JLJ0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LitafQ9JLJ0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LitafQ9JLJ0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LitafQ9JLJ0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LitafQ9JLJ0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LitafQ9JLJ0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LitafQ9JLJ0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LitafQ9JLJ0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LitafQ9JLJ0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LitafQ9JLJ0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LitafQ9JLJ0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LitafQ9JLJ0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LitafQ9JLJ0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LitafQ9JLJ0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LitafQ9JLJ0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LitafQ9JLJ0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LitafQ9JLJ0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LitafQ9JLJ0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LitafQ9JLJ0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LitafQ9JLJ0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LitafQ9JLJ0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LitafQ9JLJ0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LitafQ9JLJ0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LitafQ9JLJ0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LitafQ9JLJ0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LitafQ9JLJ0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LitafQ9JLJ0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LitafQ9JLJ0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LitafQ9JLJ0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LitafQ9JLJ0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LitafQ9JLJ0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LitafQ9JLJ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LitafQ9JLJ0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LitafQ9JLJ0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LitafQ9JLJ0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LitafQ9JLJ0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LitafQ9JLJ0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LitafQ9JLJ0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LitafQ9JLJ0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LitafQ9JLJ0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LitafQ9JLJ0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LitafQ9JLJ0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LitafQ9JLJ0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LitafQ9JLJ0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LitafQ9JLJ0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LitafQ9JLJ0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LitafQ9JLJ0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LitafQ9JLJ0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LitafQ9JLJ0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LitafQ9JLJ0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LitafQ9JLJ0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LitafQ9JLJ0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LitafQ9JLJ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LitafQ9JLJ0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LitafQ9JLJ0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LitafQ9JLJ0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms