Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC4

Sorcs1, VPS10 domain-containing receptor SorCS1, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorcs1Q9JLC4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sorcs1Q9JLC4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sorcs1Q9JLC4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sorcs1Q9JLC4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sorcs1Q9JLC4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sorcs1Q9JLC4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sorcs1Q9JLC4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sorcs1Q9JLC4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sorcs1Q9JLC4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sorcs1Q9JLC4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sorcs1Q9JLC4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sorcs1Q9JLC4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sorcs1Q9JLC4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sorcs1Q9JLC4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sorcs1Q9JLC4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sorcs1Q9JLC4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sorcs1Q9JLC4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sorcs1Q9JLC4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sorcs1Q9JLC4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sorcs1Q9JLC4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sorcs1Q9JLC4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sorcs1Q9JLC4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sorcs1Q9JLC4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sorcs1Q9JLC4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sorcs1Q9JLC4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sorcs1Q9JLC4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sorcs1Q9JLC4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sorcs1Q9JLC4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sorcs1Q9JLC4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sorcs1Q9JLC4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sorcs1Q9JLC4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sorcs1Q9JLC4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sorcs1Q9JLC4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sorcs1Q9JLC4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sorcs1Q9JLC4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sorcs1Q9JLC4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sorcs1Q9JLC4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sorcs1Q9JLC4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sorcs1Q9JLC4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sorcs1Q9JLC4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sorcs1Q9JLC4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sorcs1Q9JLC4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sorcs1Q9JLC4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sorcs1Q9JLC4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sorcs1Q9JLC4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sorcs1Q9JLC4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sorcs1Q9JLC4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sorcs1Q9JLC4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sorcs1Q9JLC4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sorcs1Q9JLC4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sorcs1Q9JLC4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sorcs1Q9JLC4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sorcs1Q9JLC4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sorcs1Q9JLC4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sorcs1Q9JLC4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sorcs1Q9JLC4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sorcs1Q9JLC4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sorcs1Q9JLC4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sorcs1Q9JLC4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sorcs1Q9JLC4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sorcs1Q9JLC4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sorcs1Q9JLC4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sorcs1Q9JLC4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sorcs1Q9JLC4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sorcs1Q9JLC4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sorcs1Q9JLC4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sorcs1Q9JLC4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sorcs1Q9JLC4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sorcs1Q9JLC4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sorcs1Q9JLC4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sorcs1Q9JLC4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sorcs1Q9JLC4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sorcs1Q9JLC4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sorcs1Q9JLC4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sorcs1Q9JLC4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sorcs1Q9JLC4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sorcs1Q9JLC4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sorcs1Q9JLC4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sorcs1Q9JLC4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sorcs1Q9JLC4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sorcs1Q9JLC4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sorcs1Q9JLC4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sorcs1Q9JLC4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sorcs1Q9JLC4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sorcs1Q9JLC4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sorcs1Q9JLC4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sorcs1Q9JLC4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sorcs1Q9JLC4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sorcs1Q9JLC4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sorcs1Q9JLC4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sorcs1Q9JLC4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sorcs1Q9JLC4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sorcs1Q9JLC4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sorcs1Q9JLC4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sorcs1Q9JLC4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorcs1Q9JLC4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorcs1Q9JLC4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorcs1Q9JLC4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorcs1Q9JLC4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorcs1Q9JLC4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms