Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Irx5Q9JKQ4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Irx5Q9JKQ4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Irx5Q9JKQ4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Irx5Q9JKQ4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Irx5Q9JKQ4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Irx5Q9JKQ4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Irx5Q9JKQ4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26,95■■□□□ 1,9
Irx5Q9JKQ4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Irx5Q9JKQ4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Irx5Q9JKQ4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Irx5Q9JKQ4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Irx5Q9JKQ4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26,92■■□□□ 1,9
Irx5Q9JKQ4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26,92■■□□□ 1,9
Irx5Q9JKQ4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Irx5Q9JKQ4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Irx5Q9JKQ4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26,92■■□□□ 1,9
Irx5Q9JKQ4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26,92■■□□□ 1,9
Irx5Q9JKQ4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Irx5Q9JKQ4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Irx5Q9JKQ4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Irx5Q9JKQ4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Irx5Q9JKQ4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Irx5Q9JKQ4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Irx5Q9JKQ4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Irx5Q9JKQ4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Irx5Q9JKQ4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Irx5Q9JKQ4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Irx5Q9JKQ4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Irx5Q9JKQ4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26,86■■□□□ 1,89
Irx5Q9JKQ4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Irx5Q9JKQ4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Irx5Q9JKQ4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Irx5Q9JKQ4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Irx5Q9JKQ4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Irx5Q9JKQ4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Irx5Q9JKQ4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Irx5Q9JKQ4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Irx5Q9JKQ4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Irx5Q9JKQ4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Irx5Q9JKQ4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Irx5Q9JKQ4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Irx5Q9JKQ4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Irx5Q9JKQ4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Irx5Q9JKQ4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Irx5Q9JKQ4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Irx5Q9JKQ4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Irx5Q9JKQ4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Irx5Q9JKQ4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Irx5Q9JKQ4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Irx5Q9JKQ4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Irx5Q9JKQ4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Irx5Q9JKQ4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Irx5Q9JKQ4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Irx5Q9JKQ4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Irx5Q9JKQ4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Irx5Q9JKQ4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Irx5Q9JKQ4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Irx5Q9JKQ4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Irx5Q9JKQ4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Irx5Q9JKQ4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Irx5Q9JKQ4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Irx5Q9JKQ4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Irx5Q9JKQ4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,7■■□□□ 1,86
Irx5Q9JKQ4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Irx5Q9JKQ4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Irx5Q9JKQ4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Irx5Q9JKQ4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Irx5Q9JKQ4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Irx5Q9JKQ4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Irx5Q9JKQ4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Irx5Q9JKQ4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Irx5Q9JKQ4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Irx5Q9JKQ4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Irx5Q9JKQ4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26,65■■□□□ 1,86
Irx5Q9JKQ4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26,65■■□□□ 1,86
Irx5Q9JKQ4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Irx5Q9JKQ4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Irx5Q9JKQ4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,62■■□□□ 1,85
Irx5Q9JKQ4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Irx5Q9JKQ4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Irx5Q9JKQ4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26,6■■□□□ 1,85
Irx5Q9JKQ4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Irx5Q9JKQ4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Irx5Q9JKQ4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Irx5Q9JKQ4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Irx5Q9JKQ4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Irx5Q9JKQ4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Irx5Q9JKQ4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Irx5Q9JKQ4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26,57■■□□□ 1,84
Irx5Q9JKQ4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Irx5Q9JKQ4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Irx5Q9JKQ4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Irx5Q9JKQ4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Irx5Q9JKQ4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Irx5Q9JKQ4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Irx5Q9JKQ4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Irx5Q9JKQ4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26,55■■□□□ 1,84
Irx5Q9JKQ4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,3 ms