Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2ird1Q9JI57 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf2ird1Q9JI57 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf2ird1Q9JI57 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf2ird1Q9JI57 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtf2ird1Q9JI57 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf2ird1Q9JI57 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf2ird1Q9JI57 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf2ird1Q9JI57 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2ird1Q9JI57 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2ird1Q9JI57 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2ird1Q9JI57 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf2ird1Q9JI57 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf2ird1Q9JI57 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf2ird1Q9JI57 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf2ird1Q9JI57 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf2ird1Q9JI57 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf2ird1Q9JI57 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf2ird1Q9JI57 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf2ird1Q9JI57 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf2ird1Q9JI57 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Gtf2ird1Q9JI57 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf2ird1Q9JI57 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf2ird1Q9JI57 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf2ird1Q9JI57 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf2ird1Q9JI57 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2ird1Q9JI57 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2ird1Q9JI57 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2ird1Q9JI57 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2ird1Q9JI57 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2ird1Q9JI57 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2ird1Q9JI57 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2ird1Q9JI57 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf2ird1Q9JI57 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2ird1Q9JI57 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2ird1Q9JI57 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2ird1Q9JI57 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2ird1Q9JI57 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2ird1Q9JI57 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf2ird1Q9JI57 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf2ird1Q9JI57 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf2ird1Q9JI57 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf2ird1Q9JI57 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf2ird1Q9JI57 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf2ird1Q9JI57 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf2ird1Q9JI57 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf2ird1Q9JI57 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2ird1Q9JI57 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2ird1Q9JI57 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2ird1Q9JI57 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2ird1Q9JI57 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gtf2ird1Q9JI57 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gtf2ird1Q9JI57 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gtf2ird1Q9JI57 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2ird1Q9JI57 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2ird1Q9JI57 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2ird1Q9JI57 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2ird1Q9JI57 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2ird1Q9JI57 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2ird1Q9JI57 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2ird1Q9JI57 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2ird1Q9JI57 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2ird1Q9JI57 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2ird1Q9JI57 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2ird1Q9JI57 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf2ird1Q9JI57 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf2ird1Q9JI57 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gtf2ird1Q9JI57 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gtf2ird1Q9JI57 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtf2ird1Q9JI57 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtf2ird1Q9JI57 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtf2ird1Q9JI57 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf2ird1Q9JI57 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf2ird1Q9JI57 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf2ird1Q9JI57 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf2ird1Q9JI57 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf2ird1Q9JI57 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf2ird1Q9JI57 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf2ird1Q9JI57 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf2ird1Q9JI57 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf2ird1Q9JI57 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf2ird1Q9JI57 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf2ird1Q9JI57 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf2ird1Q9JI57 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf2ird1Q9JI57 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf2ird1Q9JI57 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf2ird1Q9JI57 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2ird1Q9JI57 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2ird1Q9JI57 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf2ird1Q9JI57 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms