Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI9

Slc40a1, Solute carrier family 40 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc40a1Q9JHI9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc40a1Q9JHI9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc40a1Q9JHI9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc40a1Q9JHI9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc40a1Q9JHI9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc40a1Q9JHI9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc40a1Q9JHI9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc40a1Q9JHI9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc40a1Q9JHI9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc40a1Q9JHI9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc40a1Q9JHI9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc40a1Q9JHI9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc40a1Q9JHI9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc40a1Q9JHI9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc40a1Q9JHI9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc40a1Q9JHI9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc40a1Q9JHI9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc40a1Q9JHI9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc40a1Q9JHI9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc40a1Q9JHI9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc40a1Q9JHI9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc40a1Q9JHI9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc40a1Q9JHI9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc40a1Q9JHI9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Slc40a1Q9JHI9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc40a1Q9JHI9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc40a1Q9JHI9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc40a1Q9JHI9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc40a1Q9JHI9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc40a1Q9JHI9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc40a1Q9JHI9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc40a1Q9JHI9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc40a1Q9JHI9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc40a1Q9JHI9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc40a1Q9JHI9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc40a1Q9JHI9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc40a1Q9JHI9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc40a1Q9JHI9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc40a1Q9JHI9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc40a1Q9JHI9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc40a1Q9JHI9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc40a1Q9JHI9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc40a1Q9JHI9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc40a1Q9JHI9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc40a1Q9JHI9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc40a1Q9JHI9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc40a1Q9JHI9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc40a1Q9JHI9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc40a1Q9JHI9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc40a1Q9JHI9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc40a1Q9JHI9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc40a1Q9JHI9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc40a1Q9JHI9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc40a1Q9JHI9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc40a1Q9JHI9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc40a1Q9JHI9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc40a1Q9JHI9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc40a1Q9JHI9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc40a1Q9JHI9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc40a1Q9JHI9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc40a1Q9JHI9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc40a1Q9JHI9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc40a1Q9JHI9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc40a1Q9JHI9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc40a1Q9JHI9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc40a1Q9JHI9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc40a1Q9JHI9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc40a1Q9JHI9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc40a1Q9JHI9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc40a1Q9JHI9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc40a1Q9JHI9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc40a1Q9JHI9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc40a1Q9JHI9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc40a1Q9JHI9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc40a1Q9JHI9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc40a1Q9JHI9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc40a1Q9JHI9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc40a1Q9JHI9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc40a1Q9JHI9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc40a1Q9JHI9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc40a1Q9JHI9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc40a1Q9JHI9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc40a1Q9JHI9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc40a1Q9JHI9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc40a1Q9JHI9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc40a1Q9JHI9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc40a1Q9JHI9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc40a1Q9JHI9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc40a1Q9JHI9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc40a1Q9JHI9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc40a1Q9JHI9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc40a1Q9JHI9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc40a1Q9JHI9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc40a1Q9JHI9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc40a1Q9JHI9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc40a1Q9JHI9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc40a1Q9JHI9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slc40a1Q9JHI9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc40a1Q9JHI9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc40a1Q9JHI9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms