Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERZ3

Chrm3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, mousemouse

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Length 589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm3Q9ERZ3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrm3Q9ERZ3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrm3Q9ERZ3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrm3Q9ERZ3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrm3Q9ERZ3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrm3Q9ERZ3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrm3Q9ERZ3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrm3Q9ERZ3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrm3Q9ERZ3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrm3Q9ERZ3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrm3Q9ERZ3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrm3Q9ERZ3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrm3Q9ERZ3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrm3Q9ERZ3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrm3Q9ERZ3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrm3Q9ERZ3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrm3Q9ERZ3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrm3Q9ERZ3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrm3Q9ERZ3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chrm3Q9ERZ3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrm3Q9ERZ3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrm3Q9ERZ3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrm3Q9ERZ3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrm3Q9ERZ3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrm3Q9ERZ3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrm3Q9ERZ3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrm3Q9ERZ3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrm3Q9ERZ3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrm3Q9ERZ3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrm3Q9ERZ3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrm3Q9ERZ3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrm3Q9ERZ3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrm3Q9ERZ3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrm3Q9ERZ3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrm3Q9ERZ3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrm3Q9ERZ3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrm3Q9ERZ3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrm3Q9ERZ3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrm3Q9ERZ3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrm3Q9ERZ3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrm3Q9ERZ3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrm3Q9ERZ3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrm3Q9ERZ3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrm3Q9ERZ3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrm3Q9ERZ3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrm3Q9ERZ3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrm3Q9ERZ3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrm3Q9ERZ3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrm3Q9ERZ3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrm3Q9ERZ3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrm3Q9ERZ3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrm3Q9ERZ3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrm3Q9ERZ3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrm3Q9ERZ3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chrm3Q9ERZ3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrm3Q9ERZ3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrm3Q9ERZ3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrm3Q9ERZ3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrm3Q9ERZ3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrm3Q9ERZ3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrm3Q9ERZ3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrm3Q9ERZ3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrm3Q9ERZ3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrm3Q9ERZ3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrm3Q9ERZ3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrm3Q9ERZ3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrm3Q9ERZ3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrm3Q9ERZ3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrm3Q9ERZ3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrm3Q9ERZ3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms