Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER80

Rtp4, Receptor-transporting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp4Q9ER80 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtp4Q9ER80 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtp4Q9ER80 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtp4Q9ER80 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtp4Q9ER80 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtp4Q9ER80 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtp4Q9ER80 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtp4Q9ER80 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtp4Q9ER80 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtp4Q9ER80 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtp4Q9ER80 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtp4Q9ER80 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtp4Q9ER80 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtp4Q9ER80 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtp4Q9ER80 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtp4Q9ER80 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtp4Q9ER80 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtp4Q9ER80 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtp4Q9ER80 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtp4Q9ER80 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtp4Q9ER80 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtp4Q9ER80 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtp4Q9ER80 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtp4Q9ER80 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtp4Q9ER80 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtp4Q9ER80 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtp4Q9ER80 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtp4Q9ER80 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtp4Q9ER80 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtp4Q9ER80 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtp4Q9ER80 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtp4Q9ER80 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rtp4Q9ER80 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtp4Q9ER80 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rtp4Q9ER80 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rtp4Q9ER80 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtp4Q9ER80 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtp4Q9ER80 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtp4Q9ER80 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtp4Q9ER80 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtp4Q9ER80 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtp4Q9ER80 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtp4Q9ER80 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtp4Q9ER80 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtp4Q9ER80 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtp4Q9ER80 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtp4Q9ER80 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtp4Q9ER80 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtp4Q9ER80 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtp4Q9ER80 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtp4Q9ER80 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtp4Q9ER80 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtp4Q9ER80 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtp4Q9ER80 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtp4Q9ER80 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtp4Q9ER80 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtp4Q9ER80 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtp4Q9ER80 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtp4Q9ER80 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtp4Q9ER80 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtp4Q9ER80 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtp4Q9ER80 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtp4Q9ER80 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtp4Q9ER80 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtp4Q9ER80 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtp4Q9ER80 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtp4Q9ER80 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtp4Q9ER80 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtp4Q9ER80 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtp4Q9ER80 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtp4Q9ER80 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtp4Q9ER80 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtp4Q9ER80 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms