Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM6

Dgcr8, Microprocessor complex subunit DGCR8, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr8Q9EQM6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dgcr8Q9EQM6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dgcr8Q9EQM6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dgcr8Q9EQM6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dgcr8Q9EQM6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dgcr8Q9EQM6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dgcr8Q9EQM6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dgcr8Q9EQM6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dgcr8Q9EQM6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dgcr8Q9EQM6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dgcr8Q9EQM6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dgcr8Q9EQM6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dgcr8Q9EQM6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dgcr8Q9EQM6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dgcr8Q9EQM6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dgcr8Q9EQM6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dgcr8Q9EQM6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Dgcr8Q9EQM6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dgcr8Q9EQM6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dgcr8Q9EQM6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dgcr8Q9EQM6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dgcr8Q9EQM6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Dgcr8Q9EQM6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dgcr8Q9EQM6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dgcr8Q9EQM6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dgcr8Q9EQM6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dgcr8Q9EQM6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dgcr8Q9EQM6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dgcr8Q9EQM6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dgcr8Q9EQM6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dgcr8Q9EQM6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dgcr8Q9EQM6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dgcr8Q9EQM6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dgcr8Q9EQM6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dgcr8Q9EQM6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dgcr8Q9EQM6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dgcr8Q9EQM6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dgcr8Q9EQM6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dgcr8Q9EQM6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dgcr8Q9EQM6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dgcr8Q9EQM6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dgcr8Q9EQM6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dgcr8Q9EQM6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dgcr8Q9EQM6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dgcr8Q9EQM6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dgcr8Q9EQM6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dgcr8Q9EQM6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dgcr8Q9EQM6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dgcr8Q9EQM6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dgcr8Q9EQM6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dgcr8Q9EQM6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dgcr8Q9EQM6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dgcr8Q9EQM6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dgcr8Q9EQM6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dgcr8Q9EQM6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dgcr8Q9EQM6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dgcr8Q9EQM6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dgcr8Q9EQM6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dgcr8Q9EQM6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dgcr8Q9EQM6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dgcr8Q9EQM6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dgcr8Q9EQM6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dgcr8Q9EQM6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dgcr8Q9EQM6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dgcr8Q9EQM6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dgcr8Q9EQM6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dgcr8Q9EQM6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dgcr8Q9EQM6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dgcr8Q9EQM6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dgcr8Q9EQM6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dgcr8Q9EQM6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dgcr8Q9EQM6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dgcr8Q9EQM6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dgcr8Q9EQM6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dgcr8Q9EQM6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dgcr8Q9EQM6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dgcr8Q9EQM6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dgcr8Q9EQM6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dgcr8Q9EQM6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dgcr8Q9EQM6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dgcr8Q9EQM6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Dgcr8Q9EQM6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Dgcr8Q9EQM6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dgcr8Q9EQM6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dgcr8Q9EQM6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dgcr8Q9EQM6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dgcr8Q9EQM6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dgcr8Q9EQM6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dgcr8Q9EQM6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dgcr8Q9EQM6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dgcr8Q9EQM6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dgcr8Q9EQM6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dgcr8Q9EQM6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dgcr8Q9EQM6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dgcr8Q9EQM6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dgcr8Q9EQM6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dgcr8Q9EQM6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dgcr8Q9EQM6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dgcr8Q9EQM6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Dgcr8Q9EQM6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms