Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPW4

Clec3a, C-type lectin domain family 3 member A, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3aQ9EPW4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec3aQ9EPW4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec3aQ9EPW4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec3aQ9EPW4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec3aQ9EPW4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec3aQ9EPW4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec3aQ9EPW4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec3aQ9EPW4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec3aQ9EPW4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec3aQ9EPW4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clec3aQ9EPW4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec3aQ9EPW4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec3aQ9EPW4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec3aQ9EPW4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec3aQ9EPW4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec3aQ9EPW4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec3aQ9EPW4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec3aQ9EPW4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec3aQ9EPW4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec3aQ9EPW4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec3aQ9EPW4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec3aQ9EPW4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec3aQ9EPW4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec3aQ9EPW4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec3aQ9EPW4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec3aQ9EPW4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec3aQ9EPW4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clec3aQ9EPW4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clec3aQ9EPW4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec3aQ9EPW4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec3aQ9EPW4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec3aQ9EPW4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec3aQ9EPW4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec3aQ9EPW4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clec3aQ9EPW4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clec3aQ9EPW4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clec3aQ9EPW4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clec3aQ9EPW4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec3aQ9EPW4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec3aQ9EPW4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec3aQ9EPW4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec3aQ9EPW4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec3aQ9EPW4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec3aQ9EPW4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec3aQ9EPW4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec3aQ9EPW4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec3aQ9EPW4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec3aQ9EPW4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec3aQ9EPW4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec3aQ9EPW4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clec3aQ9EPW4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec3aQ9EPW4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec3aQ9EPW4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec3aQ9EPW4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec3aQ9EPW4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec3aQ9EPW4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec3aQ9EPW4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec3aQ9EPW4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec3aQ9EPW4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec3aQ9EPW4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec3aQ9EPW4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec3aQ9EPW4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec3aQ9EPW4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec3aQ9EPW4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec3aQ9EPW4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec3aQ9EPW4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec3aQ9EPW4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec3aQ9EPW4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec3aQ9EPW4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec3aQ9EPW4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec3aQ9EPW4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec3aQ9EPW4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec3aQ9EPW4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec3aQ9EPW4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec3aQ9EPW4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec3aQ9EPW4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec3aQ9EPW4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec3aQ9EPW4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec3aQ9EPW4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec3aQ9EPW4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec3aQ9EPW4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec3aQ9EPW4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec3aQ9EPW4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec3aQ9EPW4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec3aQ9EPW4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec3aQ9EPW4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec3aQ9EPW4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec3aQ9EPW4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec3aQ9EPW4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec3aQ9EPW4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec3aQ9EPW4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec3aQ9EPW4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec3aQ9EPW4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec3aQ9EPW4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec3aQ9EPW4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec3aQ9EPW4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec3aQ9EPW4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec3aQ9EPW4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clec3aQ9EPW4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clec3aQ9EPW4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms